Drosophila 12 Genomes Consortium, , Clark, A.G., Eisen, M.B., Smith, D.R., Bergman, C.M., Oliver, B., Markow, T.A., Kaufman, T.C., Kellis, M., Gelbart, W., Iyer, V.N., Pollard, D.A., Sackton, T.B., Larracuente, A.M., Singh, N.D., Abad, J.P., Abt, D.N., Adryan, B., Aguade, M., Akashi, H., Anderson, W.W., Aquadro, C.F., Ardell, D.H., Arguello, R., Artieri, C.G., Barbash, D.A., Barker, D., Barsanti, P., Batterham, P., Batzoglou, S., Begun, D., Bhutkar, A., Blanco, E., Bosak, S.A., Bradley, R.K., Brand, A.D., Brent, M.R., Brooks, A.N., Brown, R.H., Butlin, R.K., Caggese, C., Calvi, B.R., Bernardo de Carvalho, A., Caspi, A., Castrezana, S., Celniker, S.E., Chang, J.L., Chapple, C., Chatterji, S., Chinwalla, A., Civetta, A., Clifton, S.W., Comeron, J.M., Costello, J.C., Coyne, J.A., Daub, J., David, R.G., Delcher, A.L., Delehaunty, K., Do, C.B., Ebling, H., Edwards, K., Eickbush, T., Evans, J.D., Filipski, A., Findeiß, S., Freyhult, E., Fulton, L., Fulton, R., Garcia, A.C., Gardiner, A., Garfield, D.A., Garvin, B.E., Gibson, G., Gilbert, D., Gnerre, S., Godfrey, J., Good, R., Gotea, V., Gravely, B., Greenberg, A.J., Griffiths-Jones, S., Gross, S., Guigo, R., Gustafson, E.A., Haerty, W., Hahn, M.W., Halligan, D.L., Halpern, A.L., Halter, G.M., Han, M.V., Heger, A., Hillier, L., Hinrichs, A.S., Holmes, I., Hoskins, R.A., Hubisz, M.J., Hultmark, D., Huntley, M.A., Jaffe, D.B., Jagadeeshan, S., Jeck, W.R., Johnson, J., Jones, C.D., Jordan, W.C., Karpen, G.H., Kataoka, E., Keightley, P.D., Kheradpour, P., Kirkness, E.F., Koerich, L.B., Kristiansen, K., Kudrna, D., Kulathinal, R.J., Kumar, S., Kwok, R., Lander, E., Langley, C.H., Lapoint, R., Lazzaro, B.P., Lee, S.J., Levesque, L., Li, R., Lin, C.F., Lin, M.F., Lindblad-Toh, K., Llopart, A., Long, M., Low, L., Lozovsky, E., Lu, J., Luo, M., Machado, C.A., Makalowski, W., Marzo, M., Matsuda, M., Matzkin, L., McAllister, B., McBride, C.S., McKernan, B., McKernan, K., Mendez-Lago, M., Minx, P., Mollenhauer, M.U., Montooth, K., Mount, S.M., Mu, X., Myers, E., Negre, B., Newfeld, S., Nielsen, R., Noor, M.A., O'Grady, P., Pachter, L., Papaceit, M., Parisi, M.J., Parisi, M., Parts, L., Pedersen, J.S., Pesole, G., Phillippy, A.M., Ponting, C.P., Pop, M., Porcelli, D., Powell, J.R., Prohaska, S., Pruitt, K., Puig, M., Quesneville, H., Ram, K.R., Rand, D., Rasmussen, M.D., Reed, L.K., Reenan, R., Reily, A., Remington, K.A., Rieger, T.T., Ritchie, M.G., Robin, C., Rogers, Y.H., Rohde, C., Rozas, J., Rubenfield, M.J., Ruiz, A., Russo, S., Salzberg, S.L., Sanchez-Gracia, A., Saranga, D.J., Sato, H., Schaeffer, S.W., Schatz, M.C., Schlenke, T., Schwartz, R., Segarra, C., Singh, R.S., Sirot, L., Sirota, M., Sisneros, N.B., Smith, C.D., Smith, T.F., Spieth, J., Stage, D.E., Stark, A., Stephan, W., Strausberg, R.L., Strempel, S., Sturgill, D., Sutton, G., Sutton, G.G., Tao, W., Teichmann, S., Tobari, Y.N., Tomimura, Y., Tsolas, J.M., Valente, V.L., Venter, E., Venter, J.C., Vicario, S., Vieira, F.G., Vilella, A.J., Villasante, A., Walenz, B., Wang, J., Wasserman, M., Watts, T., Wilson, D., Wilson, R.K., Wing, R.A., Wolfner, M.F., Wong, A., Wong, G.K., Wu, C.I., Wu, G., Yamamoto, D., Yang, H.P., Yang, S.P., Yorke, J.A., Yoshida, K., Zdobnov, E., Zhang, P., Zhang, Y., Zimin, A.V., Baldwin, J., Abdouelleil, A., Abdulkadir, J., Abebe, A., Abera, B., Abreu, J., Acer, S.C., Aftuck, L., Alexander, A., An, P., Anderson, E., Anderson, S., Arachi, H., Azer, M., Bachantsang, P., Barry, A., Bayul, T., Berlin, A., Bessette, D., Bloom, T., Blye, J., Boguslavskiy, L., Bonnet, C., Boukhgalter, B., Bourzgui, I., Brown, A., Cahill, P., Channer, S., Cheshatsang, Y., Chuda, L., Citroen, M., Collymore, A., Cooke, P., Costello, M., D'Aco, K., Daza, R., De Haan, G., DeGray, S., DeMaso, C., Dhargay, N., Dooley, K., Dooley, E., Doricent, M., Dorje, P., Dorjee, K., Dupes, A., Elong, R., Falk, J., Farina, A., Faro, S., Ferguson, D., Fisher, S., Foley, C.D., Franke, A., Friedrich, D., Gadbois, L., Gearin, G., Gearin, C.R., Giannoukos, G., Goode, T., Graham, J., Grandbois, E., Grewal, S., Gyaltsen, K., Hafez, N., Hagos, B., Hall, J., Henson, C., Hollinger, A., Honan, T., Huard, M.D., Hughes, L., Hurhula, B., Husby, M.E., Kamat, A., Kanga, B., Kashin, S., Khazanovich, D., Kisner, P., Lance, K., Lara, M., Lee, W., Lennon, N., Letendre, F., LeVine, R., Lipovsky, A., Liu, X., Liu, J., Liu, S., Lokyitsang, T., Lokyitsang, Y., Lubonja, R., Lui, A., MacDonald, P., Magnisalis, V., Maru, K., Matthews, C., McCusker, W., McDonough, S., Mehta, T., Meldrim, J., Meneus, L., Mihai, O., Mihalev, A., Mihova, T., Mittelman, R., Mlenga, V., Montmayeur, A., Mulrain, L., Navidi, A., Naylor, J., Negash, T., Nguyen, T., Nguyen, N., Nicol, R., Norbu, C., Norbu, N., Novod, N., O'Neill, B., Osman, S., Markiewicz, E., Oyono, O.L., Patti, C., Phunkhang, P., Pierre, F., Priest, M., Raghuraman, S., Rege, F., Reyes, R., Rise, C., Rogov, P., Ross, K., Ryan, E., Settipalli, S., Shea, T., Sherpa, N., Shi, L., Shih, D., Sparrow, T., Spaulding, J., Stalker, J., Stange-Thomann, N., Stavropoulos, S., Stone, C., Strader, C., Tesfaye, S., Thomson, T., Thoulutsang, Y., Thoulutsang, D., Topham, K., Topping, I., Tsamla, T., Vassiliev, H., Vo, A., Wangchuk, T., Wangdi, T., Weiand, M., Wilkinson, J., Wilson, A., Yadav, S., Young, G., Yu, Q., Zembek, L., Zhong, D., Zimmer, A., Zwirko, Z., Jaffe, D.B., Alvarez, P., Brockman, W., Butler, J., Chin, C., Gnerre, S., Grabherr, M., Kleber, M., Mauceli, E., MacCallum, I. (2007). Evolution of genes and genomes on the Drosophila phylogeny.
Nature 450(7167): 203--218.